Pochodzący z Asahi w prefekturze Yamagata, najmłodszy z pięciorga dzieci, Honda studiował film na wydziale sztuki Uniwersytetu Nihon, gdzie pomimo trudnych warunków edukacyjnych poświęcał wolny czas na oglądanie kina. W 1934 roku wkroczył do przemysłu filmowego jako trzeci asystent reżysera, a po piętnastu latach pracy nad licznymi produkcjami zadebiutował reżyserią krótkiego dokumentu „Ise-Shima”…